Caracterización molecular de las cepas de Bradyrhizobium japonicum J-01, J-96 y J-98, mediante protocolos rep-PCR

Publicado
2013-01-17
Sección
Microbiología del suelo

Palabras clave

Variedad; Polimorfismo; Oxisol; Iniciador
  • Ruben A. Valencia R. CORPOICA
  • Linda Y. Gómez A CORPOICA

Resumen

El cultivo de la soya (Glycinemax (L.) Merril), en oxisoles de la Orinoquia colombiana presenta restricciones por la alta saturación de aluminio y en general, baja capacidad de intercambio catiónico (CIC) y de materia orgánica (MO), que afectan la fijación biológica del nitrógeno (N) y el crecimiento normal de las plantas. Una alternativa ambiental, a este problema es inocular las plantas con diferentes cepas de Bradyrhizobium japonicum. Las cepas de B. japonicum J-96 y J-98 se constituye en una opción de fijación biológica de nitrógeno altamente efectivas para las variedades de soja, en la Orinoquia colombiana. En este trabajo se determinaron los patrones moleculares de cepas J-01, J-96 y J-98, a partir de los primers Box-PCR y Eric- PCR. Se logró establecer diferencias genéticas entre estas, las cuales pueden ser de utilidad para complementar futuros programas de identificación de individuos, estudios poblacionales y selección asistida. Las cepas de B. japonicum J-96 y J-98, constituyen nuevas opciones de variedades biológicas para fijación de nitrógeno de soya altamente eficaces en el Orinoco colombiano. 

 

 

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Biografía del autor

Ruben A. Valencia R., CORPOICA
Centro de Investigación Tibaitatá, Mosquera.
Linda Y. Gómez A, CORPOICA
Centro de Biotecnología y Bioindustria, Centro de Investigación Tibaitatá, Mosquera.
¿Cómo citar?
VALENCIA R., Ruben A.; GÓMEZ A, Linda Y.. Caracterización molecular de las cepas de Bradyrhizobium japonicum J-01, J-96 y J-98, mediante protocolos rep-PCR. Corpoica Ciencia y Tecnología Agropecuaria, [S.l.], v. 13, n. 2, p. 196-200, jan. 2013. ISSN 2500-5308. Disponible en: <http://revista.corpoica.org.co/index.php/revista/article/view/255>. Fecha de acceso: 20 oct. 2017 doi: https://doi.org/10.21930/rcta.vol13_num2_art:255.

Citas

Amézquita E, Hoyos Ph, Molina D. 2005. Mejoramiento de la calidad del suelo en rotación maíz-soya en la altillanura colombiana. En: Resúmenes III Seminario Regional Agrociencia y Tecnología Siglo XXI Orinoquia Colombiana. Villavicencio, Colombia: Corpoica. p. 45.

Barcellos F, Menna P, Da Silva Batista J, Hungria M. 2007. Evidence of horizontal transfer of symbiotic genes from a Bradyrhizobium japonicum inoculant strain to indigenous diazotrophs Sinorhizobium (Ensifer) fredii and Bradyrhizobium elkanii in a Brazilian Savannah soil. Appl Environ Microbiol 73:2635-2643.

Batista J, Hungria M, Barcellos F, Ferreira M, Mendes I. 2007. Variability in Bradyrhizobium japonicum and B. elkanii seven years after introduction of both the exotic microsymbiont and the soybean host in a Cerrados soil. Microbial Ecol 53:270-284.

Bianchi C, Carter T, Bailey Jr M, Mian M, Rufty T, Ashley D, Boerma H, Arellano C, Hussey R, Parrott W. 2000. Aluminum tolerance associated with quantitative trait loci derived from soybean PI 416937 in hydroponics. Crop Sci 40:538-545.

Boddey L, Hungria M. 1997. Phenotypic grouping of Brazilian Bradyrhizobium strains which nodulate soybean. Biol Fertil Soils 25:407-415.

Borkert C, Sfredo G. 1995. La fertilización de los suelos tropicales para el cultivo de la soya. En: El cultivo de la soya en los trópicos. Mejoramiento y producción. Roma: Colección FAO: Producción y Protección Vegetal No. 27. pp. 175-200.

De Bruijn F. 1992. Use of repetitive (repetitive extragenic palindromic and enterobacterial repetitive intergenic consensus) sequences and the polymerase chain reaction to fingerprint the genomes of Rhizobium meliloti isolates and other soil bacteria. Appl Environ Microbiol 58(7):2180-2187.

De Bruijn F, Rademaker J, Schneider M, Rossbach U, Louws F. 1996. Rep-PCR genomic fingerprinting of plant-associated bacteria and computer-assisted phylogenetic analyses. En: Stacey G, Mullin B, Gresshoff P, editores. Biology of plant-microbe interaction; Proceedings of the 8th International Congress of Molecular Plant- Microbe Interactions. Saint Paul, MN: APS Press. pp. 497-502.

Dice LR. 1945. Measures of the amount of ecologic association between species. Ecology 26:297-302.

Fernández CM. 2003. Manual de nodulación. Buenos Aires: Editorial Hemisferio Sur.

Ferreira M, Hungria M. 2002. Recovery of soybean inoculant strains from uncropped soils in Brazil. Field Crops Res 79:139-152.

Giongo G, Ambrosini A, Vargas L, Freire J, Bodanese M, Passaglia L. 2008. Evaluation of genetic diversity of bradyrhizobia strains nodulating soybean [Glycine max (L.) Merrill] isolated from South Brazilian fields. Appl Soil Ecol 38:261-269.

Godoy, L, Vasconcelos A, Chueire L, Souza R, Nicolas M, Barcellos F, Hungria M. 2008. Genomic panorama of Bradyrhizobium japonicum CPAC 15, a commercial inoculant strain largely established in Brazilian soils and belonging to the same serogroup as USDA 123. Soil Biol Biochem 40:2743-2753.

Hungria M, Boddey L, Santos M, Vargas M. 1998. Nitrogen fixation capacity and nodule occupancy by Bradyrhizobium japonicum and B. elkanii strains. Biol Fertil Soils 27:393-399.

Hungria M, Vargas M. 2000. Environmental factors affecting N2 fixation in grain legumes in the tropics, with an emphasis on Brazil. Field Crops Res 65(2-3):151-164. Hungria M, Campo R, Mendes I, Graham P. 2006. Contribution of biological nitrogen fixation to the nitrogen nutriton of grain crops in the tropics: the success of soybean (Glycine max L. Merr) in South america. En: Singh RP, Shankar N, Jaiwal PK, editores. Nitrogen nutrition in plant productivity. Houston, TX: Studium Press; LLCC, pp. 43-93.

Judd A, Schneider M, Sadowsky M, Bruijn F. 1993. Use of repetitive Sequences and the polymerase chain reaction technique to classify genetically related Bradyrhizobium japonicum serocluster 123 strainst. Appl Environ Microbiol 59(6):1702-1708.

López, S, Perticari, A, Piccinetti, C, Ventimiglia L, Arias A, De Battista J, Althabegoiti M, Mongiardini E, Pérez J, Quelas J, Lodeiro A. 2009. In-Furrow inoculation and selection for higher motility enhances the efficacy of Bradyrhizobium japonicum nodulation. Agron J 101:357-363.

Louws F, Rademaker J, Bruijn F. 1999.The three Ds of PCR-based genomic analysis of phytobacteria: diversity, detection, and disease diagnosis. Annu. Rev. Phytopathol. 37:81-125.

Molina D, Amézquita E, Hoyos Ph. 2003. Construcción de capas arables en suelos oxisoles de la Altillanura colombiana. Evaluación de parámetros y procesos hidrológicos en el suelo. En: VII Escuela Latinoamericana de Física de Suelos. La Serena, Chile. pp. 113-117.

Perticari A, Arias N, Baigorri H, De Battista J, Lett, L, Montecchia M, Pacheco J, Simonella A, Toresani S, Ventimiglia L, Vicentini R. 2003. Inoculación y fijación biológica de nitrógeno en el cultivo de soja. En: El libro de la soja. Quito: SEMA. pp. 69-76.

Rakhi A, Bajoria S, Pareek P. 2006. DNA Isolation from Rhizobium by phenol chloroform method. En: Birla Institute of Scientific Research, http://www.protocol-online.org; consulta: noviembre, 2012.

Rivas L, Hoyos Ph, Amezquita E, Molina D. 2004. Manejo y usos de los suelos de la altillanura colombiana. Proyecto de evaluación de impacto. Palmira, Colombia: MADR; CIAT.

Rohlf F. 1997. Software NTSYS-pc. Numerical taxonomy and multivariate analysis system versión 2.02. New York: Exeter Software Publishers.

Salamanca C, Ramírez M. 2000. ICA J 01 Biofertilizante para soya. Inoculante de rizobio para los Llanos Orientales. Villavicencio, Colombia: Corpoica; Ministerio de Agricultura. FOCC.

Santos M, Vargas M, Hungria M. 1999. Characterization of soybean Bradyrhizobium strains adapted to the Brazilian savannas. FEMS Microbiol Ecol 30:261-272.

Schloter M, Lebuhn M, Heulin T, Hartmann A. 2000. Ecology and evolution of bacterial microdiversity. FEMS Microbiol Rev 24(5):647-660.

Versalovic J, Schneider M, De Bruijn F, Lupski J. 1994. Genomic fingerprinting of bacteria using repetitive sequence-based polymerase chain reaction. Meth Mol Cell Biol 5,25-40.

Vincent J. 1970. A manual for the practical study of root nodule bacteria. Oxford, UK: Blackwell Scientific.

Von H, Mutert E. 1995. Global extent, development and economicimpact of acid soils. Plant Soil 171:1-15.

Xue Z, Muilenburg M, Lie T, Jun Z, Fu L. 1999. Characterization of soybean rhizobia at different levels using PCR based techniques. Biodiv Sci 7(4):277-284.